Pepti-drift：无需推理时引导的可扩展安全活性肽生成

arXiv:2606.27824v3 公告类型：替换 摘要：治疗性肽是一种前景广阔的药物形式，但其生成必须满足多项治疗约束。我们提出 BindSafe-PepBench，这是一项固定预算基准测试，在同一批生成候选物上联合评估靶标结合能力和四项主要安全性指标。我们发现，肽长是联合结合—安全性评估中的主要混杂因素：较长的肽往往具有更强的预测结合能力，但预测安全性较差。这会造成表面上的权衡，并可能使具有不同输出长度分布的模型之间的比较产生偏差。我们报告绝对安全活性产率（Safe-Active yield）和精确长度匹配增益，以区分生成能力改进与输出长度效应。较高的安全活性产率仍然颇具挑战，而性能最强的多属性方法依赖代价高昂的推理时引导。因此，我们提出 Pepti-drift，这是一种单步生成框架，将对靶标特异性结合肽的吸引作用与对责任相关区域的排斥作用结合起来，仅需进行一次潜变量细化，随后即可并行解码，无需推理时引导。在 88 个留出靶标上，Pepti-drift 达到 18.37% 的预测安全活性产率，同时保持正向的精确长度匹配增益。与多属性引导基线相比，该方法取得了具有竞争力的增益，同时生成成本降低了 468 倍，从而支持可扩展且公平的高通量肽设计。